Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF839-209ENST00000559185 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 EPS8L3-203ENST00000369805 2325 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.9 ms