Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DEDD-203ENST00000458050 2300 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SUV39H1-201ENST00000337852 2978 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMEM184B-201ENST00000361684 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PLIN5-206ENST00000592610 1903 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PCDHGB5-201ENST00000617380 4578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NUTM2A-201ENST00000381689 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRR5L-216ENST00000530639 2291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PCID2-204ENST00000375459 1668 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RASGEF1A-203ENST00000395809 4104 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FGD5P1-201ENST00000611158 3374 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SYT10-201ENST00000228567 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 UGT1A4-201ENST00000373409 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 FANCM-208ENST00000556036 2354 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 AC092447.8-201ENST00000566570 4162 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 HPSE2-203ENST00000370552 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CAPN9-203ENST00000366666 2173 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SLC16A6-205ENST00000620436 2055 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 LRRC8B-202ENST00000358200 1957 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 MATN1-201ENST00000373765 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
UBE2V1Q13404 ELF5-205ENST00000532417 2330 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms