Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSEN1P49768 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms