Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms