Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCAMP43121 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms