Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MLH1P40692 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MLH1P40692 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MLH1P40692 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms