Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM21P19474 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms