Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CTLA4P16410 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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