Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VEGFAP15692 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms