Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 UGT1A8-201ENST00000373450 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms