Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC00271-202ENST00000436554 655 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DMDP11532 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 SRSF10-205ENST00000374452 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AKTIP-201ENST00000300245 2133 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 PAGE4-202ENST00000376141 487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DMDP11532 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DMDP11532 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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