Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HKR1P10072 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HKR1P10072 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms