Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM10L1P0DMW3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms