Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 GGTA1P-202ENST00000481534 3429 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TYMSP04818 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TYMSP04818 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms