Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LMNAP02545 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LMNAP02545 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LMNAP02545 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LMNAP02545 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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