Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms