Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1LI1Q9Y6G9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms