Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EMILIN1Q9Y6C2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
EMILIN1Q9Y6C2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EMILIN1Q9Y6C2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms