Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms