Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDHB4Q9Y5E5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCDHB4Q9Y5E5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms