Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMED5Q9Y3A6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED5Q9Y3A6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms