Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED16Q9Y2X0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED16Q9Y2X0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms