Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FNDC3AQ9Y2H6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FNDC3AQ9Y2H6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FNDC3AQ9Y2H6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms