Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EFR3BQ9Y2G0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms