Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC9A8Q9Y2E8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms