Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SSX2IPQ9Y2D8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms