Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF5Q9Y2D1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATF5Q9Y2D1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms