Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NCKAP1Q9Y2A7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1Q9Y2A7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1Q9Y2A7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms