Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHKBQ9Y259 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHKBQ9Y259 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHKBQ9Y259 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms