Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC3Q9UQE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMC3Q9UQE7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMC3Q9UQE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms