Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAPRE3Q9UPY8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAPRE3Q9UPY8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAPRE3Q9UPY8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAPRE3Q9UPY8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAPRE3Q9UPY8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms