Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIAA1024Q9UPX6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
KIAA1024Q9UPX6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIAA1024Q9UPX6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms