Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGSF9BQ9UPX0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGSF9BQ9UPX0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IGSF9BQ9UPX0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms