Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHTF1Q9UMS5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHTF1Q9UMS5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms