Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN11Q9UMQ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPN11Q9UMQ6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPN11Q9UMQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms