Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO6Q9UM54 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO6Q9UM54 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO6Q9UM54 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms