Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DENND2AQ9ULE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DENND2AQ9ULE3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DENND2AQ9ULE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms