Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYH13Q9UKX3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYH13Q9UKX3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYH13Q9UKX3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms