Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PACSIN3Q9UKS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PACSIN3Q9UKS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms