Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TSPAN16Q9UKR8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN16Q9UKR8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms