Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM4Q9UKN5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM4Q9UKN5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms