Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CHIC2Q9UKJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHIC2Q9UKJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms