Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROTQ9UKG9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROTQ9UKG9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms