Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNL1Q9UK58 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNL1Q9UK58 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms