Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C3orf18Q9UK00 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C3orf18Q9UK00 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms