Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNMT3LQ9UJW3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNMT3LQ9UJW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms