Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID2Q9UJV3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID2Q9UJV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms