Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERC5Q9UII4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERC5Q9UII4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms