Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK1NQ9UHG2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK1NQ9UHG2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms