Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBGCP4Q9UGJ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBGCP4Q9UGJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBGCP4Q9UGJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms